化肥作為一種施用簡單、快捷、省工省時且速效的肥料，在近半世紀的農業生產中占據了重要地位，不可否認，化肥的使用推動了糧食產量的突破性增長，也解決了國計民生的大問題，但近年來，單純過量使用化肥帶來的負面影響也呈增長趨勢，這其中造成的危害已成為影響人類生存發展的社會問題。
我們最常用的化肥主要以氮、磷、鉀大量元素為主，能極大地刺激作物的生長，但長期單純地過量使用，致使土壤中缺少微生物生長繁殖的骨架C（碳）元素，微生物含量也大大降低。缺少微生物的活動，土壤熟化不能完成，久而久之，不可避免的雨水沖刷、淋溶作用流失的水土，得不到補充，耕作層變淺，土壤生產能力下降。
其次，健康的土壤結構是土質疏松，具備良好的保水保肥能力，這其中最主要的因素是土壤有機質和微生物共同作用下產生膠體，土壤膠體將土壤原生質體粘合成團粒結構，而長期單純的化肥使用完全打破了這一規律，有機質和微生物的越來越匱乏，土壤板結、鹽漬化等加劇，作物根系生長環境嚴重惡化，最終結果是化肥用量不斷增加，作物產量下降。
第三、與有機肥相比，化肥更像是一劑西藥，長期單純施用化肥，作物質地疏松、體內游離氨基酸含量增加，易倒伏，病蟲害危害顯著增加，其它抗逆性能也顯著降低。
第四，單施化肥的作物，生長迅速，細胞內水分含量增加，有效養分含量降低，食之淡而無味，農產品風味、品質、營養價值明顯下降。
第五，長期過量使用化肥，土壤微量元素及礦物元素被消耗殆盡，作物中硒、鉬等微量元素等長期匱乏，再加上化肥導致的農產品所含亞硝酸鹽類等有害物質顯著提高，大大降低人體生命健康抵抗力，是癌癥發生的重要誘因。
第六，化肥的生產制造過程對環境污染非常大；化肥使用后只有30%被作物吸收利用，70%的化肥使用量流入水渠、江河、湖泊、大海，使得飲水含人體有害物質，如亞硝酸鹽類等，直接構成對人體生命健康危害；水體富營養化后，動植物病原微生物、水生有害生物如雜草、藻類等在水體中能夠生存，并大量繁殖，增加人體與其它有益生物的發病機率，給水產品養殖構成嚴重危害。
據測定，單施化肥土壤的生產力每年下降0.2%，單施化肥五百年后，農田將成為荒地，化肥的使用不僅害人害己，而且貽害子孫后代。
針對拋棄化肥，必須拿出一個保證作物持續高產、產品質量安全、環保的完美解決方案，該方案必須滿足可利用土地面積增加有限的人類對質量安全食品不斷增長的需要。近年來農業部出臺的一系列限制農藥化肥使用以及有機肥補貼補助方案，我們已經看到國家對這一問題的重視以及改革的決心，碳菌肽素作為一種多元化的新興的有機肥產品，也在致力于一條打破常規的道路，相信只要通過各方面的不斷努力，我們賴以生存的土地和環境一定會有一個大的改善。
