對于不同的堆肥原料，某些生產參數的變化情況并不完全一致。物料含水量、物料的配比參數（碳氮比）、溫度、酸堿度、發酵時間等因素隨物料的不同而異。在實際生產過程中，這些參數還有待于進一步確定，從而使產品更加穩定。
二、商品有機肥發酵工藝的確定
發酵工藝主要包括自然或生物發酵、好氧或厭氧發酵、不發酵。不同的堆肥原料應采用相應的發酵劑，以達到快速腐熟的目的。目前，普遍強調固氮、解磷、解鉀等功能菌的作用，而忽視了生物發酵過程中存在的生理活性物質或酶的作用，忽視了有機物質的改土增效作用，進而出現了許多用實驗室的優良菌種制成的肥料幾乎無作用的現象，給消費者造成虛假宣傳的不良影響。
① 好氧通氣發酵。該發酵方式是生產商品有機肥的常用方式。該工藝存在的問題主要是發酵過程中有惡臭氣體產生，在通風階段尤為嚴重，一些廠家缺乏必要的處理裝置而將其直接排放到大氣中，危害到人體和大氣；其次是增加了設備及污染控制的投資，增加了生產成本，還造成養分特別是碳、氮的損失較大。
② 發酵菌種質量。目前生產中使用的發酵菌種質量差異較大，許多實驗室中培養的菌種，盡管其活菌數含量很高，但難以在發酵生產中取得良好效果；反之，復合菌種盡管菌數含量較低并有雜菌污染，但采用復合菌種的發酵效果較好。因此，應在生產前進行必要的菌種質量比較試驗，以確保發酵效果良好。
③ 有機物料接種有機肥發酵劑的操作技術。實驗室培養的菌種的特性因品種不同而異，適應環境的能力不同，對接種的技術要求也不同。而接種是有機肥生產中的重要環節，接種操作技術部規范，會影響有機肥的產量和質量。探討行之有效的、專一的菌種接種技術，是有機肥生產廠家不可回避的問題。
三、商品有機肥腐熟度的確定
腐熟度的研究是一個復雜的工作。溫度和PH的變化不能作為堆肥腐熟程度判別的全部指標。應充分利用化學分析法得到的參數，結合表觀分析法對堆肥的腐熟程度作出判斷。腐熟的堆肥中溫度呈下降趨勢，腐殖質的含量有所減少，堆料呈黑褐色，無惡臭味道，質地松軟，無明顯水分，蚊蠅等不再繁殖。
四、商品有機肥干燥工藝的確定
商品有機肥干燥法主要包括自然干燥、人工干燥、人工機械干燥和復合干燥。商品有機肥干燥工藝的弊端主要是粉塵污染。
① 械化人工高溫快速干燥商品有機肥。在連續大規模生產商品有機肥時，必須使用烘干設備。盡管目前烘干溫度僅為60-80℃，但烘干帶來的空氣污染、有效菌活力降低、養分損失等問題還較為突出。生物發酵干燥、保護設施日光干燥等技術利用生物能和日光能，可大幅度降低水分，再輔以機械耗能干燥，可較好地解決以上問題。亦可在不同季節采用不同組合方式進行干燥處理。
② 解決粉塵污染問題。生產中的粉塵污染給生產和環境帶來了許多負面效應。目前采用的解決方法主要有：增加全封閉風送設施，采取重點污染區增加除塵器或采取先制粒再低溫烘干的辦法，以降低污染。
要想生產出優質商品有機肥，原料、技術、工藝以及嚴格的檢測手段缺一不可，廣大用戶在選擇有機肥生產廠家的過程中，一定要注意考察，如果生產廠家連基本的檢測中心都沒有，那產品的品質以效果肯定也沒有保證可言。
