微生物群落在所有生態系統中都發揮著重要的作用，但對控制這些群落組裝的生態過程卻缺乏全面的了解。為了解析微生物之間的生物相互作用在土壤微生物群組裝和功能中的作用，作者使用了一種基于去除自然土壤微生物群落中的不同種群方法。作者假設，去除某些微生物群將強烈影響許多其他微生物群的相對適應度，從而闡明生物相互作用在塑造土壤微生物群中的貢獻。

研究表明，39%的優勢細菌類群在土壤再接種過程中受到了競爭相互作用，這凸顯了生物相互作用在土壤微生物群落組裝中的重要性。此外，這一方法能夠識別微生物群落的組裝規律，例如Bacillales和Proteobacteriales成員之間的競爭排除。改變生物相互作用對氮循環的改變大于碳循環相關的活性變化。該方法為研究復雜生態系統中的微生物相互作用以及微生物群落組成與生態系統功能之間的聯系提供了一條新途徑。